Luigi Ricciardi 1 , Rosa Mazzeo 2,*© , Angelo Raffaele Marcotrigiano 1 , Guglielmo Rainardi 3 , Paolo Iovieno 4 , Vito Zonno 1 , Stefano Pavan 1© me Concetta Lotti 2,*
- 1 Te Tari o te Whenua, Te Tipu me te Putaiao Kai, Te Tipu Genetics and Breeding Unit Te Whare Wananga o Bari, Via Amendola 165/A, 70125 Bari, Itari; luigi.ricciardi@uniba.it (LR);angelo.marcotrigiano@uniba.it (ARM); vito.zonno@uniba.it (VZ); stefano.pavan@uniba.it (SP)
- 2 Te Tari o te Putaiao Ahuwhenua, Kai me te Taiao, Te Whare Wananga o Foggia, Via Napoli 25, 71122 Foggia, Itari
- 3 Department of Biosciences, Biotechnologies and Biopharmaceuticals, University of Bari, Via Orabona 4, 70125 Bari, Italy; guglielmo.rainaldi@uniba.it
- 4 Te Tari Hangarau Hangarau, Bioenergy, Biorefinery and Green Chemistry Division, ENEA Trisaia Research Centre, SS 106 Ionica, km 419+500, 75026 Rotondella (MT), Italy; paolo.iovieno@enea.it
* Raarangi: rosa.mazzeo@unifg.it (RM); concetta.lotti@unifg.it (CL)
waitara:
riki (Allium cepa Ko L.) te tuarua o nga hua huawhenua tino nui puta noa i te ao, e mihi nui ana mo ona painga hauora. Ahakoa tona hiranga nui ohaoha me tona uara hei kai mahi, he iti te rangahau o te riki e pa ana ki te kanorau ira. I konei, i tirotirohia e matou te rereketanga o te ira i roto i te "Acquaviva red onion" (ARO), he whenua whenua me nga hitori o te rau tau o te maara i tetahi taone iti i te kawanatanga o Bari (Apulia, Tonga o Itari). I whakamahia he huinga 11 tohu microsatellite ki te tuhura i te rereketanga ira i roto i te kohinga germplasm e 13 nga taupori ARO me nga momo tauhokohoko noa e toru. Ko nga tātaritanga o te hanganga ira me nga tikanga parametric me te kore-parametric i whakaatu ko te ARO te tohu i te puna ira kua tino tautuhia, he tino rereke mai i nga whenua o Tropea me Montoro e pohehe ana. Hei whakarato i te whakamaarama mo nga topuku, ka whakamahia mo te kai hou, ka arotakengia te kiko totoka whakarewa me te piro, e whakaatu ana i te reka ake o te ARO e pa ana ki nga whenua whenua e rua kua whakahuahia ake nei. I te katoa, ka whai hua te rangahau o naianei mo te whakakaha ake i te ARO, ka taea te whakatairanga ma nga tapanga kounga ka taea te whakaiti i nga mahi tinihanga me te whakapai ake i nga moni whiwhi a te hunga iti.
Kupu Whakataki
Kei roto i te puninga Allium e 750 pea nga momo [1], kei roto i enei ko te riki (Allium cepa L., 2n = 2x =16) tetahi o nga mea tino whanui. Ko te A. cepa he huringa rua-tau me te whakawhiti i te whanonga uri. I enei wa, ko te hanga riki i te ao (97.9 Mt) te tuarua o nga hua huawhenua tino nui i muri i te tomato [2]. Mai i nga wa onamata, kua whakamahia nga topuku riki hei kai, hei rongoa tangata. Inaa, kua korerohia e nga Ihipiana o mua he maha nga tikanga rongoa i runga i te whakamahinga o te karika me te aniana i roto i te papyrus rongoa o te 1550 BC, te Codex Ebers [3].
Ko tenei huawhenua whai kiko me te hauora ka kainga mata, hou, hei hua tukatuka ranei, ka whakamahia hei whakanui i te reka o nga rihi maha. He maha nga rangahau tata nei e kii ana ka taea e te kai riki te whakaiti i te mate o te mate ngakau [4,5], te momi [6], te mate huka [7], me nga momo mate pukupuku [8-10]. He maha nga wa e kiia ana nga hua hauora riki ki nga taumata teitei o nga karaehe e rua o nga puhui huaora: flavonoids me te alk(en)yl cysteine sulphoxides (ACSOs). Ko te akomanga tuatahi ko te flavonols me te anthocyanins. Ko Quercetin te flavonol tino kitea, e mohiotia ana mo te kaha o te antioxidant me nga taonga anti-inflammatory i roto i te scavenging tuwhena kore utu me te whakawhiti katote whakarewa here. [11]; ko te anthocyanins he whero/papura te tae ki etahi momo riki. Mo nga ACSO, ko te tino nui ko te isoalliin [(+)-trans-S-1-propenyl-L-cysteine sulfoxide] [12], he waikawa amino whanariki-kore, kore-proteinogenic hoki e rongoa ana i roto i nga ruma, he mea autaki mo te kakara me te reka o te aniana. [13]. I runga i te pakarutanga o te kiko, ka mawehea te isoalliin e te enzyme alliinase ki te whakaputa i te raupapa o te puhui puhoi (pyruvate, ammonia, thiosulphonates me te propanethial S-oxide) ka puta te haehae me te hongi kino. [14]. I te nuinga o te wa ka inehia te riki o te riki ki te nui, mo ia karamu o te taumaha hou, o te waikawa pyruvic i hangaia e te hauwai. [15,16].
I roto i nga whenua o te moana Mediterranean, whakaarohia hei tetahi o nga pokapū kanorau tuarua o A. cepa [17,18], ka whakaatu nga topuku riki i te rerekeetanga o te ahua, te rahi, te tae, te mea maroke, me te ngangau [19-22]. I tua atu, ko te whakakikiritanga i runga i te whanariki, nga tikanga agronomic, te momo oneone, nga ahuatanga o te rangi, me te momo momo momo maara, whenua whenua ranei ka awe i te kounga o te umanga ma te tuku i nga uara motuhake me nga uara kai. [23-27]. I Itari, ahakoa te whanui o te germplasm riki, he iti noa nga momo riki ka tukuna ki nga rangahau pūtaiao me te tohu tika. [28,29].
Ko te tino tohu ira me te tohu tohu o te agro-biodiversity he mea tino nui ki te whakapumau i te tiaki tika i nga rawa ira tipu me te whakatairanga i te whakamahinga o nga momo momo ira motuhake i roto i te mekameka uara. [30-32]. He maha nga wa i whiriwhiria ai nga tohu tukurua raupapa ngawari (SSR) hei mapi [33-35], te matimati DNA me te whakahāweatanga maara [36-38], me te whakatau tata pono mo te rereketanga o te ira i roto, i waenga hoki i nga whenua [39-42], i te mea he waahi motuhake, he maha-allelic, he mea tuku iho, he tino taea te whakaputa, he pai hoki mo te whakaira-ira aunoa.
I roto i te rangahau o tenei wa, i arotahi matou ki tetahi whenua tuku iho o Apulian, te "Acquaviva red riki" (ARO), e whakatipuhia ana i runga i nga tikanga ahuwhenua waro i tetahi waahi iti o te taone o Acquaviva delle Fonti, i te kawanatanga o Bari. (Apulia, Itari Tonga). Ko nga topuku o tenei whenua he nui, he papatahi, he whero te tae, ka whakamahia i roto i nga tohutao o te rohe. Ahakoa i riro i te ARO te tohu kounga "Slow Food Presidium", ka taea te whakatairanga ake me te tiaki i tana whakaputanga e nga tohu kounga o te Kotahitanga o Europi penei i te tohu tohu whenua (PGI) me te tohu whakamarumaru o te takenga (POD), na te mea ka whai waahi enei ki te whakaiti i te nga mahi tinihanga me te whakapai ake i nga moni whiwhi a te hunga iti. I konei, i whakamahia nga tohu rapoi SSR hei taputapu kaha ki te aromatawai i te rereketanga o te ira i waenga i nga taupori ARO me te wehewehe i tenei whenua mai i etahi atu whenua riki whero o Itari ki te Tonga. I tua atu, i whakatauhia e matou te ngangau me nga ihirangi totoka whakarewa hei arotake i te reka o te ARO e pa ana ki te hiahia o te maakete.
hua
Te Whakaputanga o te Acquaviva Red Onion Germplasm Collection me te Tohu Morphological
Ko nga kakano o te 13 taupori o te whenua ARO, i kohaina e nga kaiahuwhenua i roto i te anga o te kaupapa BiodiverSO Apulia Region i whakamahia ki te whakatu i te kohinga germplasm ARO.
Ko nga korero mo te ahua o te ahua, e pa ana ki te topuku, te kiri, me te kikokiko i kohia i runga i te germplasm ARO me nga whenua riki e toru, e rua no te "Tropea red riki" (TRO) landrace me tetahi ki te "Montoro copper onion" (MCO) landrace (Whakaahua. 1). Ko nga topuku ARO katoa he papatahi, he whero te kiri o waho me te kikokiko he rereke nga tae whero. He rerekee, he tino whero te kiko o nga topuku TRO, engari ko te kiko o nga topuku MCO he kino te tae (Ripanga S1). Ka taea te tātari matū koiora ki te aro mātai i te totoka wairewa me te piro. I korerotia i te Ripanga 1, ko nga uara toharite o nga topuku wairewa totoka i roto i nga taupori ARO he 7.60, mai i te 6.00 (ARO12) ki te 9.50° Brix (ARO11 me ARO13). He teitei ake tenei uara i te mea i kiia mo nga whenua TRO me MCO (4.25 me te 6.00° Brix, ia).
Ripanga 1. Ihirangi Wairewa Toka me nga Uara Pungency I Aromatawaia i roto i te Taupori “Acquaviva Red Onion” (ARO), “Tropea Red Onion” (TRO), me “Montoro Copper Onion” (MCO) *.
CODE | Ihirangi Mārō Wairewa (Brix) | Pungency (pmolg-1 FW) | ||
Putanga | CV y (%) | Putanga | CV y (%) | |
ARO1 | 6.25 D * | 5.65 | 5.84 ab * | 23.78 |
ARO2 | 7.25 DC | 4.87 | 6.51 a | 22.98 |
ARO3 | 7.50 BCD | 9.42 | 5.28ab | 22.88 |
ARO4 | 7.50 BCD | 0.00 | 6.97 a | 3.74 |
ARO 5 | 7.50 BCD | 0.00 | 6.80 a | 9.68 |
ARO6 | 6.25 D | 5.65 | 4.51ab | 39.18 |
ARO7 | 7.25 DC | 4.87 | 5.25ab | 15.44 |
ARO8 | 9.00 AB | 0.00 | 7.04 a | 3.49 |
ARO9 | 8.25 ABC | 4.28 | 6.84 a | 0.15 |
ARO10 | 7.00 DC | 0.00 | 5.94ab | 6.57 |
ARO11 | 9.50 He | 7.44 | 5.54ab | 16.43 |
ARO12 | 6.00 D | 0.00 | 4.91ab | 9.70 |
ARO13 | 9.50 He | 7.44 | 6.63 a | 24.93 |
MCO | 6.00 D | 0.00 | 4.18ab | 2.66 |
TRO1 | 4.25 E | 8.31 | 2.80 b | 2.10 |
TRO2 | 4.25 E | 8.31 | 4.28ab | 4.79 |
* Ko te tikanga he rite nga reta ki te pumatua, puriki ranei, kaore i te rereke te tatauranga ki te 0.01P, te 0.05P ranei (Te Whakamatau a SNK). y Te whakarea o te rereketanga.
Ko te uara toharite o te kaha o te ARO, i aromatawaihia e te ihirangi waikawa pyruvic, he 6.00, mai i te 4.51 pmol g-1 FW (ARO6) ki te 7.04 (ARO8). He teitei ake tenei uara i te mea i kiia i roto i nga whenua TRO me MCO (3.54 pmol g-1 FW me te 4.18 pmol g-1 FW, ia).
SSR Polymorphism and Genetic Relationships among Accessions
I roto i te rangahau o naianei, 11 o te 37 nga huinga tuatahi o te SSR i whakamatauria i whakarato i nga polymorphisms-locus kotahi, ara, e rua nga hua whakakaha i te nuinga o te tangata kotahi. I te katoa, 55 nga alleles i kitea i roto i nga tangata 320 me te maha o nga alleles mo ia waahi mai i te 2 (ACM147 me te ACM 504) ki te 11 (ACM132) me te uara toharite o te 5 alleles (Ripanga 2). I roto i nga taupori takitahi, ko te maha o nga alleles (Na) mai i te 1.94 (ACM147 me te ACM504) ki te 5.38 (ACM132), engari ko te tau whai hua o nga alleles (Ne) mai i te 1.41 (ACM152) ki te 2.82 (ACM449). Nga rereke i waenganui i nga uara Na me Ne na te noho o nga alleles he iti te auau i roto i nga taupori me te kaha o etahi noa nga alleles. Ko te uara heterozygosity (Ho) teitei i kitea mo te ACM138 me te ACM449 (0.62), engari ko te mea iti rawa e hono ana ki te ACM152 (0.25). Ko te heterozygosity e tumanakohia ana (He), e rite ana ki te tumanakohanga ariā i roto i te taupori panmictic, mai i te 0.37 (ACM504) ki te 0.61 (ACM132, ACM138, me te ACM449). Ko te taupū whakatika a Wright (Fis), i whakaatu i nga uara tata ki te kore (0.05 toharite) mo nga tohu katoa, e tohu ana i nga uara rite i waenga i nga taumata heterozygosity kua kitea me te tumanako, pera me te tumanako mo tetahi momo whakawhiti. Ko te kaha o te tohu SSR takitahi i roto i te maihao ira i whakatauhia e te taurangi korero polymorphic (PIC), me te uara toharite o 0.48 me te awhe mai i te 0.33 (ACM504) ki te 0.67 (ACM132). Ko tetahi atu taurangi kakama, ko te Shannon's Information Index (I) i whakaatu i te uara toharite o te 0.84, me te whakaaro mai i te 0.45 (ACM152) ki te 1.20 (ACM132).
Ripanga 2. Polymorphism Nga Ahuatanga o nga Tohu SSR 11 i Whakamahia hei Whakatau i te Kanorau Ira i roto i nga Taupori ARO, TRO, MCO. Te Tau Tapeke o nga Alleles (Na), te Awhe Rahi Paihere, me te Taurangi Ihirangi Moohiohio Polymorphic (PIC) Tirohia te Huinga Tapeke o te 320 Takitahi i Whakaraupapahia i roto i tenei Akoranga. Te maha o nga Alleles (Na), te maha o nga Alleles whai hua (Ne), te Heterozygosity (Ho), te Heterozygosity e tumanakohia ana (He), te Taurangi Whakatikatika (Fis), me te Taurangi Paarongo a Shannon (I) e tohu ana ki nga Uara Tikanga I Tatauhia mai i nga Taupori 16, Ia Titoa e 20 Takitahi.
Locus. | Tapeke Na | Awhe Rahi (bp) | Pic | Putanga | |||||
Na | Ne | Ho | He | I | Fis | ||||
ACM91 | 4 | 189-205 | 0.40 | 2.63 | 1.72 | 0.38 | 0.39 | 0.66 | 0.04 |
ACM101 | 4 | 229-241 | 0.52 | 2.94 | 2.37 | 0.53 | 0.56 | 0.92 | 0.06 |
ACM132 | 11 | 186-248 | 0.67 | 5.38 | 2.78 | 0.55 | 0.61 | 1.20 | 0.09 |
ACM138 | 5 | 242-272 | 0.66 | 3.69 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.09 | -0.02 |
ACM147 | 2 | 264-266 | 0.37 | 1.94 | 1.83 | 0.44 | 0.44 | 0.62 | -0.01 |
ACM152 | 4 | 228-244 | 0.25 | 2.38 | 1.41 | 0.25 | 0.27 | 0.45 | 0.07 |
ACM235 | 4 | 286-298 | 0.41 | 2.81 | 1.77 | 0.44 | 0.41 | 0.72 | -0.06 |
ACM446 | 6 | 108-120 | 0.56 | 3.50 | 2.48 | 0.49 | 0.58 | 1.01 | 0.16 |
ACM449 | 8 | 120-140 | 0.66 | 4.88 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.18 | -0.03 |
ACM463 | 5 | 202-210 | 0.47 | 3.38 | 1.95 | 0.46 | 0.48 | 0.83 | 0.05 |
ACM504 | 2 | 188-192 | 0.33 | 1.94 | 1.64 | 0.30 | 0.37 | 0.54 | 0.20 |
Putanga | 5 | 0.48 | 3.22 | 2.15 | 0.46 | 0.48 | 0.84 | 0.05 |
I roto i nga taupori, ko ARO3, ARO6, ARO8, ARO10, TRO1, me MCO i whakaatu i te taumata teitei o te rereketanga o te ira (Ho > 0.5), engari ko te iti rawa o te rereketanga i kitea i roto i te taupori ARO7 (Ho = 0.27) (Ripanga Tāpiri S2). I te katoa, ko nga whakaurunga katoa i whakaatuhia a Fis uara tata ki te kore (Fis uara toharite = 0.054), i runga i te tumanako i raro i nga tikanga whakahiato matapōkere.
Tātaritanga o te Rerekētanga Molecular me te Hanganga Ira
Ko te wehewehenga o te rereketanga o te ira i waenga i roto i nga taupori i tatauhia e AMOVA. I kitea e nga hua he hautanga nui o te rereketanga ira i roto i nga taupori (87%). Ko te rereketanga i waenga i nga taupori, 13%, he tino hira (P <0.001) (Ripanga 3). Ko nga uara takirua o te tawhā Fpt, he rite ki te taupū whakatika Fst a Wright, mai i te 0.002 (ARO2/ARO10) ki te 0.468 (ARO7/TRO2), he mea nui (P <0.05), haunga mo nga whakataurite takirua e iwa (Ripanga Tāpiri S3).
Ripanga 3. Tātaritanga o te rerekētanga rāpoi o te 320 momo momo mai i te 16 Taupori o Allium cepa L.
pūtake | df | Tuhinga o mua | Tatau rereke | Rerekētanga (%) | Fpt | P |
I waenga i nga taupori | 15 | 458.63 | 1.16 | 13 orau | ||
I roto i nga taupori | 304 | 2272.99 | 7.50 | 87 orau | 0.134 | 0.001 |
tapeke | 319 | 2731.62 | 8.66 |
Te tirotiro i te hanganga ira i roto i te A. cepa Ko te kohinga ira tangata i roto i tenei rangahau i mahia ma te whakamahi i te tauira whakaurunga-a-te-a-te-a-te-a-te-a-te-a-raa i te wetewetetanga whakahiato i whakatinanahia i roto i te STRUCTURE rorohiko. I whakaarohia e te tikanga Evanno AK kia wehewehea kia rua nga tautau (K = 2) hei tino korero mo a maatau takakau,me the muri teitei peak i K = 5 (Tuhinga Whakanuia S1). He mo K = 2, ahpopnga tikanga wte kaiheigned ki onme tef nga tautau e rua mā te he whakarea rnernbertoip (q) > 0.7. Ka rite ki shown i roto Figure 2a, ko te huinga tuatahi (ko S1 te ingoa) ko MCO me nga taupori ARO katoa, engari ko te roopu S2 i whakarōpū i nga taupori TRO e rua. I te K = 5, he whakamaarama hohonu ake mo te huingararaunga (Whakaahua 2b), 75% o nga whakaurunga i whakawhiwhia ki tetahi o nga roopu e rima. I whakapumauhia te wehenga i waenga i te ARO (S1) me te TRO (S2), ahakoa i whakauruhia etahi taupori ARO (q <0.7) kua whakarōpū wehea ranei i roto i nga tautau hou e rua S3 me S4 (ARO7 me ARO12). He mea whakamiharo, ko te momo arumoni MCO i hanga he tautau motuhake (S5) wehea mai i te riki whero Apulian.
Whanaungatanga Ira i waenga i nga Taupori
Ko te polymorphism SSR ka whakaaetia ki te tuhi dendrogram o te kanorau ira me nga hua o te tātaritanga phylogenetic e whakaatuhia ana i te Whakaahua. 3a. I konei, ka wehewehea te kohinga germplasm ki nga roopu e rima e kaha tautokona ana e nga uara bootstrap. Ko te taupori ARO7 me te ARO12 i wehea tonu mai i nga toenga taupori ka hanga e rua nga tautau motuhake. Ko te roopu tuatoru ko nga taupori arumoni e rua o TRO, i tenei wa ka wehea e te pona tuawha a MCO mai i nga taupori ARO tekau ma tahi. Ko te hononga ira e tupu ana i waenga i nga taupori i tirotirohia ano e te tikanga o te tātari ruruku matua (PCoA) (Whakaahua 3b). Ka rite ki te korero o mua, i whakarōpūhia nga taupori ARO, haunga mo ARO12 me ARO7, i puta ki nga waahi motuhake i te papa PCoA. Ko nga TRO e rua me nga taupori MCO i marara ki te taha matau-raro o te waahi.
Whakaatu 3. Te kanorau ira i waenga i te 16 A. cepa nga taupori e tohuhia ana i roto i tenei rangahau, i runga i o raatau tohu SSR. (a) UPGMA dendrogram o te tawhiti ira. Ko nga uara tautoko Bootstrap> 50 e tohuhia ana i runga ake i nga waahanga e rite ana; (b) te tātari wae matua (PCoA). Ko te kapoi i porowhitatia ki te whero ka rite ki te roopu i hangaia e te tātaritanga phylogenetic me te 11 nga whakaurunga ARO.
Aparauraa
I roto i te nui o te agro-biodiversity i whakatipuhia i te tonga o Itari, ko nga whenua riki he tohu mo nga hua motuhake e tika ana kia tiakina mai i te tupono o te horo ira me te riri ka whakakapihia e nga maara hou. I roto i te anga o te kaupapa a-rohe BiodiverSO, e whai ana ki te kohikohi, ki te tohu, ki te whakatairanga, ki te tiaki i nga rawa ira o te rohe o Apulia e tino hono ana ki nga taonga tuku iho o te rohe, i whakatuu he kohinga kakano o nga taupori 13 o te whenua ARO. I korerotia e matou te aromatawai tuatahi mo te rereketanga o te ARO i runga i te DNA polymorphisms me nga tawhā koiora e rua, te totoka whakarewa me te ihirangi waikawa pyruvic, e pa ana ki nga ahuatanga reka me te mea nui mo te whakaae ki nga hua hou kaore ano kia maoa. I tua atu, i whakatauritehia nga raraunga mo te whenua ARO ki era i kohia i runga i etahi atu whenua riki e rua e pohehe ana.
I kitea e nga tātaritanga matū koiora te reka o te taupori 13 ARO, e pa ana ki te nui o te wairewa totoka me te kawa waenga, e ai ki nga aratohu ahumahi riki reka. [31]. He reka ake nga topuku ARO i era o nga whenua whenua TRO me MCO, a he paku teitei ake te ahua. Heoi, ko te reka o te aniana na te taurite i waenga i te huka me te kawa, no reira ka whai hua tenei ahuatanga ki te tautoko i te kowhiringa o nga momo momo uara, ka mahia e nga kaiahuwhenua i runga i te ahua o te ahua.
Ko nga tohu SSR i whakapumautia he taputapu whai hua ki te wehewehe i nga momo momo ira, ahakoa ka kohia i roto i te waahi tipu whaiti penei i te taone o Acquaviva delle Fonti. Ko nga tohu kua tohua he nui ake te maha o nga alleles i nga tohu i korerohia i mua [43] a [44], engari he iti ake i nga tohu i korerotia e [45]. I tua atu, 50% o a maatau huinga tohu i whakaatu i nga uara taupū PIC nui ake i te 0.5, e whakaatu ana he pai ki te wehewehe i nga taupori i roto i te kohinga, pera i te whakaaro [46]. Ko te aromatawai i te kanorau i roto i nga taupori i kitea nga uara rite i waenga i a Ho me He, na te iti o te Fis uara. E whakaae ana tenei ki te ahua whakawhiti-waho o A. cepa, e tino mate ana i te pouri o te whanautanga [47]. Ko te Fis Ko te uara i tatauhia i roto i nga taupori riki i whakaarohia i roto i tenei rangahau (0.054) he iti iho i tera i korerotia i mua [45] (0.22) me te rite tonu ki tera i kitea e [31] (0.08) me [48] (0.00) nana i aromatawai te kanorau ira i roto i nga whenua riki mai i te hauauru o Spain me Niger. Ko nga taumata whakahirahira o te heterozygosity i roto i nga taupori ARO e whakapumau ana i te whakaaro ko Apulia te tohu he pokapū kanorau mo te maha o nga momo ahuwhenua. [32, 42, 49-51].
I tohuhia e AMOVA ko te nuinga o nga rereketanga ngota i roto i te kohinga ira i roto i tenei rangahau kei roto i nga taupori. Heoi ano, he nui te rereketanga ira i waenga i nga taupori (FPT uara) i whakaatu mai te puta mai o te whakapapa ira. Inaa, ahakoa i tohu a maatau hua i te noho riterite o te ira i roto i te nuinga o nga taupori ARO, i te hanga i te kahui kua tino tautuhia, ko nga taupori ARO7 me ARO12 i whakaatu i tetahi tohu ira tino rerekee. He rereke te takenga mai o nga kakano i whakamahia e nga kaiahuwhenua e rua i kohia ai nga taupori. I tua atu, i runga i nga hua ka puta, ka taea te whakaaro he rereke te ARO whenua i te taumata ira mai i nga whenua TRO me MCO. I roto i tetahi rangahau tata nei, [29] i aromatawaihia te kanorau ira o etahi whenua riki o Itari tae atu ki "Acquaviva," "Tropea," me "Montoro." Ahakoa i whakamahia e nga kaituhi nga tohu SNP hei aromatawai i te rereketanga o te ira o te kohinga riki whanui, kaore i taea e te tohu ira tangata te wehewehe "Acquaviva" mai i "Tropea" me "Montoro" aniana. Tena pea, na te iti o te uara PIC toharite i kitea (0.292), e kii ana he iti noa nga korero mo te waahi i raro i te tātaritanga e kii ana [29]. I tua atu, ki te tirotiro i te ahua o te hanganga-iti i roto i to raatau roopu Itari, he pai ake te wetewete i nga momo momo Itariana me wehe ke atu i te toenga o te kohinga. Tena pea ka taea te kite i te tauira o te kanorau ira e hono ana ki te whakarōpūtanga matawhenua, ki nga ahuatanga ranei i raro i te kowhiringa a-iwi.
Hei whakamutunga, ko te rangahau o naianei he purongo matawhānui e pa ana ki te whenua riki e pa ana ki nga taonga tuku iho o te rohe me te hiranga ohaoha mo nga kaiahuwhenua. Ko o maatau hua e whakaatu ana, me etahi o nga mea rereke, ko te ARO e tohuhia ana e tetahi puna ira kua tino tautuhia, e tika ana kia tiakina mai i te tupono o te horo ira. No reira, he mea tino nui te whakaturanga kohinga o tenei puna nui o te kanorau ira. Ka mutu, ka whai hua pea te tohu ira me te tohu tohu o te ARO ki te whiwhi tohu kounga mai i te Kotahitanga o Europi.
Nga Rauemi me nga Rautaki
Kohinga Germplasm, Rauemi Tipu, me te Tangohanga DNA
He huinga taupori 13 o te whenua ARO i riro mai i roto i te anga o te kaupapa o te Rohe Apulia (BiodiverSO: https://www.biodiversitapuglia.it/), na roto i te raupapa o nga misioni i mahia i "Acquaviva delle Fonti", he taone iti o Apulian i Porowini o Bari, Itari. Ko nga waahi kohinga o ia whakaurunga i maatakihia ma te Geographic Information System (GIS) ka ripoatahia ki te Ripanga 4. I tua atu, e rua nga taupori mai i te whenua TRO me tetahi taupori mai i te whenua MCO i whakauruhia ki roto i te rangahau o tenei wa ka whakamahia hei tohutoro. Ko nga mea tipu katoa i whakatipuhia i roto i nga ahuatanga taiao i te paamu whakamatautau "P Martucci" o te Whare Wananga o Bari (41° 1'22.08″ N, 16°54'25.95″ E), i raro i te whare herehere hei karo i te whitiwhitinga o waenga. taupori me te whakapumau i te whitiwhitinga o roto-taupori ma te namu (Lucilia caesar). I tohuhia nga taupori 16 mo nga ahuatanga e pa ana ki te rahi me te ahua o te umanga me te tae kiri me te kiko (Ripanga S1). I tua atu, i mahia te whakamatautau i roto i te totoka wairewa ma te whakamahi i te refractometer a-ringa, me te inenga i roto i nga tauira wai riki me te taapiri 2,4-dinitrophenyl hydrazine (0.125% v/v i roto i te 2N o te HCl) me te arotake i te whakaurunga i te 420 nm, pera i te korero a [31]. Ko te whakamatautau awhe maha a Duncan me te whakamatautau SNK i mahia hei whakatau i te ahua o nga rereketanga nui.
Ripanga 4. Te Rarangi o nga Taupori i Kohia me te Whakatauira i roto i tenei Akoranga. Mo ia Taupori, Waehere Tautuhinga, Ingoa Rohe, Taururuku GPS, me te Peeke Gene e Tiaki ana i nga Kakano.
Code | ingoa | GPS Coordinates | Peeke Gene y |
ARO1 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’21.708″ N 16°49’1.631” E | Di.SSPA |
ARO2 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’14.28″ N 16°48’56.879” E | Di.SSPA |
ARO3 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’11.304″ N 16°49’13.079” E | Di.SSPA |
ARO4 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’3.348″ N 16°40’27.011” E | Di.SSPA |
ARO5 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°51’59.76″ N 16°53’0.527” E | Di.SSPA |
ARO6 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’48.72″ N 16°49’43.247” E | Di.SSPA |
ARO7 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’13.47″ N 16°50’23.783” E | Di.SSPA |
ARO8 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’18.816″ N 16°49’33.888” E | Di.SSPA |
ARO9 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54'51.372″ N 16°49'3.504" E | Di.SSPA |
ARO10 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’1.188″ N 16°49’24.311” E | Di.SSPA |
ARO11 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52'49.8″ N 16°49'48.575" E | Di.SSPA |
ARO12 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’38.892″ N 16°49’28.379” E | Di.SSPA |
ARO13 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’21.768″ N 16°49’29.711” E | Di.SSPA |
TRO1 | Cipolla rossa haere i Tropea | - | Di.SSPA |
TRO2 | Cipolla rossa tonda di Tropea | - | Di.SSPA |
MCO | Cipolla ramata di Montoro | - | Di.SSPA |
y Di.SSPA, Te Tari Whenua, Te Tipu me te Putaiao Kai, Te Whare Wananga o Bari. |
Ko nga mea rau e 20 nga momo momo ira tangata mo ia taupori ka whakatauirahia ka rongoa ki te -80 °C kia whakamahia ra ano. Mo nga momo polysaccharide-taonga, hei A. cepa, Ko nga mahi tuatahi ki te tango i te polysaccharide he mea nui kia whiwhi ai i te DNA-kounga pai, no reira ko nga horoinga tuatahi i roto i te STE buffer (0.25 M sucrose, 0.03 M Tris, 0.05 M EDTA) i mahia peratia i whakaahuatia e [52]. I tangohia te DNA katoa i muri i te tikanga CTAB [53] ka mutu ka tirohia mo te kounga me te kukū e Nano Drop 2000 UV-vis spectrophotometer (ThermoScientific, Waltham, MA, USA) me te 0.8% agarose gel electrophoresis.
Tātaritanga SSR
16 nga huinga tuatahi EST-SSR i whakawhanakehia e [54] a i whakamatauria i mua i roto i nga rangahau kanorau ira na [43] a [44] me te 21 genomic SSR [45-55] i tirotirohia ki te arotake i to raatau pai (Ripanga Tāpiri S4). I mahia te tohu-a-ira ma te whakamahi i te tikanga tohu tohu rewharewha ohaoha ka taapirihia te hiku M13 ki ia tuatahi SSR whakamua. [56]. I whakaritea nga ranunga PCR i roto i te 20 gL tauhohenga kei roto: 50 ng o te tapeke DNA, 0.2 mM o te ranunga dNTP, 1X o te PCR tauhohenga buffer, 0.8 U o DreamTaq DNA polymerase (Thermo Scientific, Waltham, MA, USA), 0.16 gM o te tuatahi whakamuri , 0.032 gM o te tuatahi o mua i whakaroahia me te raupapa M13 (5′-TGTAAAACGACGGCCAGT-3′), me te 0.08 gM o te kaupapa tuatahi M13 i tapaina ki te FAM, NED ranei nga waikano fluorescent (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA). Ko nga tauhohenga PCR i mahia i roto i te SimpliAmp (Applied Biosystems, CA, USA) thermocycler me nga tikanga e whai ake nei mo te nuinga o nga takirua tuatahi: 94 °C mo te 5 min, 40 huringa i te 94 °C mo te 30 s, 58 °C mo te 45 s me te 72 °C mo te 45 s me te whakaroa whakamutunga i te 72 °C mo te 5 min. Mo te ACM446 me te ACM449, i whakamahia he PCR pa ki te 60 °C ki te 55 °C i runga i nga huringa 10, 30 huringa i te 55 °C, ka whai i te toronga whakamutunga o te 5 min i te 72 °C. I utaina nga hua PCR ki te pereti 96-puna me te konatunatua ki te 14 gL o Hi-Di Formamide (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) me te 0.5 gL GeneScan 500 ROX Rahi Paerewa (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA). I whakatauhia nga Amplicons ma te ABI PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) miihini whakahiato kapi, i tohua ai nga alleles hei rangatira tahi me te tohu ma te whakamahi i te GeneMapper Software Version 3.7.
Ko nga punaha GenAlEx 6.5 [57] me Cervus 3.0.7 [58] i whakamahia ki te whakatau tata i te maha o nga alleles (Na), te maha o nga alleles whai hua (Ne), te heterozygosity (Ho), te heterozygosity (He), te ihirangi korero polymorphic (PIC), te taupū korero a Shannon (I), me te taupū whakatika (Fis ) mo ia waahi SSR.
Te Aromatawai o te Kanorau Ira
Ko te wehewehenga o te rereketanga o te ira i roto i te taupori riki i arotakea e GenAlEx 6.5 [57] na roto i te tātaritanga o te rerekee ngota (AMOVA) me te 999 bootstrapping hei whakamatautau mo te hiranga. I tua atu, i whakamahia te rorohiko GenAlEx 6.5 ki te whakatau tata i te kanorau o ia taupori ma te tatau i te toharite o Ho, He, me Fis i runga i te waahi SSR katoa.
Ko te hanganga taupori i whakatauhia e te Bayesian tauira-a-te-te-te-rangi algorithm i whakatinanahia i roto i te rorohiko STRUCTURE v.2.3.4 [59]. I whakahaeretia te huinga raraunga me te maha o nga kahui whakapae (K), mai i te 1 ki te 10, te whakatakoto i nga oma motuhake tekau mo ia uara K. Mo ia oma, ko te whai ki te manatoko i te rite o nga hua, 100,000 te wa wera tuatahi me te 100,000 Markov Chain Monte Carlo (MCMC) i mahia i raro i te tauira whakauru me nga iarere allele motuhake i waenga i nga taupori. Ko te uara K tino pea i whakatauhia ma te whakamahi i te tikanga AK, i whakaahuatia e [60], i roto i te kaupapa tukutuku STRUCTURE HARVESTER [61]. I tautapahia te taupori takitahi ki tetahi kahui motuhake i te wa i teitei ake te taupori mema (uara-q) i te 0.7, ki te kore ka kiia he whakapapa hono.
I mahia te tātaritanga ruruku matua kia kite i nga tauira o te hononga ira i waenga i nga whakaurunga e whakaatuhia ana e te matrix tawhiti ira a Nei (Ripanga Tāpiri S5). I runga i nga iarere allele, i hangaia he dendrogram o te tawhiti ira ma te whakamahi i te tikanga roopu takirua kore taumaha me te wetewete tauwaenga (UPGMA) tātari tautau i roto i te rorohiko POPTREEW [62]. I tonohia te Bootstrapping ki te aromatawai i te maiatanga ki te whakarapopototanga aroākapa, me te whakarite i te 100 te tauira tauira o te huinga raraunga. Ka mutu, ko te rorohiko MEGA X [63] i whakamahia hei rorohiko tuhi rakau.
Rauemi Tāpiri: Ko nga e whai ake nei e waatea ana i runga ipurangi http://www.mdpi.com/2223-7747/9/2/260/s1. Ripanga S1: Te ahua o te ahua o nga topuku ARO, MCO me TRO. Ripanga S2: Heterozygosity me nga tohu whakatika kua tatauhia mo nga whenua ARO me nga whenua TRO me MCO. Ripanga S3: Uara takirua o te tawhā Fpt. Ripanga S4: Rarangi o nga SSR i whakamahia i roto i te rangahau. Ripanga S5. Matrix taupori takirua o Nei ira tawhiti. Whakaahua S1: Ka huri te tūtohi raina o nga uara K me te Delta K a Evanno.
Kaituhi Kaihauturu: Na CL me LR te ako me te hoahoa i te whakamatautau; I mahi a CL me PI i te tātaritanga tohu tohu rapoi; I mahia e ARM me VZ nga whakamatautau mara; Ko te RM, SP, GR, me CL i uru ki te tātari raraunga; I tuhia e RM raua ko CL nga tuhinga. Ko nga kaituhi katoa kua panui me te whakaae ki te putanga whakaputa o te tuhinga.
Te Moni: Ko tenei mahi i utua e te kaupapa Apulian a rohe "Biodiversity of Apulian momo huawhenua"—Programma di Sviluppo Rurale per la Puglia 2014-2020. Misura 10—Sottomisura 10.2; tuku KUP H92C15000270002, Itari.
mihi: Me mihi ki a "Azienda Agricola Iannone Anna" me "Associazione produttori della vera cipolla rossa di Acquaviva" mo te whakarato i nga taonga tipu i whakamahia i roto i te whakamatautau.
Nga raruraru o nga hiahia: Kaore nga kaituhi i whakaatu he pakanga.
Tohutoro
- 1. Stearn, WT E hia nga momo Allium e mohiotia ana? Kew Mag. 1992, 9, 180-182. [CrossRef]
- 2. FAOSTAT. FAO Tatauranga Tauanga. Kei runga ipurangi: http://www.fao.org/2017 (i uru atu i te 8 o Hanuere 2019).
- 3. Block, E. Te matū o te karika me te riki. Sci. Am. 1985, 252, 114-119. [CrossRef]
- 4. Lee, B.; Jung, JH; Kim, HS Aromatawai o te riki whero mo te mahi antioxidant i roto i te kiore. Kai Chem. Toxicol. 2012, 50, 3912-3919. [CrossRef]
- 5. Lee, SM; Marama, J.; Chung, JH; Cha, YJ; Shin, MJ Te awenga o nga tangohanga kiri riki-nui ki te quercetin mo te thrombosis arterial i roto i te kiore. Kai Chem. Toxicol. 2013, 57, 99-105. [CrossRef] [PubMed]
- 6. Yoshinari, O.; Shiojima, Y.; Igarashi, K. Nga hua anti-obesity o te tangohanga riki i roto i nga kiore ngako mate huka zucker. Ngā matūkai 2012, 4,1518-1526. [CrossRef]
- 7. Akash, MSH; Rehmana, K.; Chen, S. Spice plant Allium cepa: Te taapiri kai mo te maimoatanga o te mate huka momo 2. kai tōtika 2014, 30, 1128-1137. [CrossRef] [PubMed]
- 8. Wang, Y.; Tian, WX; Ma, XF Nga Painga Whakakore o te riki (Allium cepa L.) tangohanga mo te tipu o nga pūtau mate pukupuku me te adipocytes ma te aukati i te synthase waikawa ngako. Ahia Pac. J. Cancer Prev. 2012,13, 5573-5579. [CrossRef] [PubMed]
- 9. Rai, WW; Hsu, SC; Chueh, FS; Chen, YY; Yang, JS; Lin, JP; Lien, JC; Tsai, CH; Ko Chung, ko JG Quercetin te aukati i te heke me te whakaekenga o te SAS o te hunga mate pukupuku waha tangata na roto i te aukati i te NF-kappaB me te matrix metalloproteinase-2/-9 tohu tohu. Te mate pukupuku Res. 2013, 33, 1941-1950. [PubMed]
- 10. Nicastro, HL; Ross, SA; Milner, JA Karika me te aniana: Ko o raatau taonga aukati mate pukupuku. Te mate pukupuku Prev. Res. 2015, 8,181-189. [CrossRef]
- 11. Forte, L.; Torricelli, P.; Boanini, E.; Gazzano, M.; Rubini, K.; Fini, M.; Bigi, A. Ko nga hua o te antioxidant me te hanga wheua o te quercetin-functionalized hydroxyapatite: He rangahau i roto i te in vitro osteoblast-osteoclast-endothelial cell co-culture. Acta Biomate. 2016, 32, 298-308. [CrossRef]
- 12. Yamazaki, Y.; Iwasaki, K.; Mikami, M.; Yagihashi, A. Te tohatoha o nga kaikawe kakara tekau ma tahi, S-Alk(en)yl-L-cysteine derivatives, i roto i nga huawhenua Allium e whitu. Kai Sci. Hangarau. Res. 2011, 17, 55-62. [CrossRef]
- 13. Poraka, E. Ko te matū okana whanariki o te Genus Allium—Ko nga paanga mo te matū waro o te whanariki. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1992, 31, 1135-1178. [CrossRef]
- 14. Griffiths, G.; Trueman, L.; Crowther, T.; Tamati, B.; Smith, B. Onions-He painga o te ao mo te hauora. Phytother. Res. 2002,16, 603-615. [CrossRef]
- 15. Schwimmer, S.; Weston, WJ Te whakawhanaketanga enzymatic o te waikawa pyruvic i roto i te riki hei inenga o te piro. J. Agric. Kai Chem. 1961, 9, 301-304. [CrossRef]
- 16. Ketter, CAT; Randle, WM Te aromatawai Pungency i roto i te riki. I roto Nga Akoranga Whakamatauria mo te Whakaako Taiwhanga; Karcher, SJ, Ed.; Association for Biology Laboratory Education (ABLE): New York, NY, USA, 1998; Buka 19, api 177-196.
- 17. Hanelt, P Taxonomy, evolution, and history. I roto Riki me nga Maaa Hoa, Vol. I. Botany, Physiology and Genetics; Rabinowitch, HD, Brewster, JL, Eds.; CRC Press: Boca Raton, FL, USA, 1990; api 1-26.
- 18. Rabinowitch, HD; Kura, L. Putaiao Putaiao Allium: Nga Whakahoutanga Hou; Whakaputa CABI: Wallingford, UK, 2002.
- 19. Mallor, C.; Carravedo, M.; Estopanan, G.; Mallor, F. Te tohu o nga rauemi ira o te riki (Allium cepa L.) mai i Spanish tuarua pokapū o te kanorau. Awha. J. Agric. Res. 2011, 9, 144-155. [CrossRef]
- 20. Ferioli, F.; D'Antuono, LF Aromātai o te phenolics me te cysteine sulfoxides i roto i te riki me te germplasm shallot mai Itari me Ukraine. Genet. Rauemi. Croop Evol. 2016, 63, 601-614. [CrossRef]
- 21. Petropoulos, SA; Fernandes, A.; Barros, L.; Ferreira, ICFR; Ntatsi, G. He whakaahuatanga moo, kai me te matū o 'vatikiotiko', he whenua riki no Kariki. Kai Chem. 2015,182, 156-163. [CrossRef]
- 22. Liguori, L.; Adiletta, G.; Nazzaro, F.; Fratianni, F.; Di Matteo, M.; Albanese, D. Biochemical, āhuatanga antioxidant me te mahi antimicrobial o nga momo riki rereke i te rohe Mediterranean. J. Kai Meas. Pūāhua. 2019,13, 1232-1241. [CrossRef]
- 23. Yoo, KS; Pike, L.; Crosby, K.; Jones, R.; Leskovar, D. He rereke nga rereke o te riki riki na te tipu, te taiao tipu, me te rahi o te umanga. Sci. Hortic. 2006,110, 144-149. [CrossRef]
- 24. Beesk, N.; Perner, H.; Schwarz, D.; George, E.; Kroh, LW; Rohn, S. Te tohatoha o te quercetin-3, 4′-O-diglucoside, quercetin-4′-O-monoglucoside, me te quercetin i roto i nga waahanga rereke o te pupuhi riki (Allium cepa L.) i awehia e te momo momo. Kai Chem. 2010,122, 566-571. [CrossRef]
- 25. Caruso, G.; Conti, S.; Villari, G.; Borrelli, C.; Melchionna, G.; Minutolo, M.; Russo, G.; Amalfitano, C. Nga paanga o te wa whakawhiti me te kiato o te tipu ki te hua, te kounga me te ihirangi antioxidant o te riki (Allium cepa L.) i te tonga o Itari. Sci. Hortic. 2014,166, 111-120. [CrossRef]
- 26. Perez-Gregorio, MR; Regueiro, J.; Simal-Gandara, J.; Rodrigues, AS; Almeida, DPF Te whakanui ake i te uara taapiri o te aniana hei puna o te flavonoids antioxidant: He arotake tino nui. Kowhi. Rev. Food Sci. Kaiora. 2014, 54,1050-1062. [CrossRef] [PubMed]
- 27. Pohnl, T.; Schweiggert, RM; Carle, R. Te awenga o te tikanga whakatipu me te kowhiringa maara ki nga warowaiwa whakarewa me nga maataapono ngau i roto i te aniana. (Allium cepa L.). J. Agric. Kai Chem. 2018, 66, 12827-12835. [CrossRef] [PubMed]
- 28. Tedesco, I.; Carbone, V.; Spagnuolo, C.; Minasi, P.; Russo, GL Te tautuhi me te inenga o nga flavonoids mai i nga maara Itari e rua ki te tonga o Allium cepa L., Tropea (riki whero) me Montoro (riki parahi), me to ratou kaha ki te tiaki i nga erythrocytes tangata mai i te ahotea oxidative. J. Agric. Kai Chem. 2015, 63, 5229-5238. [CrossRef]
- 29. Villano, C.; Esposito, S.; Carucci, F.; Frusciante, L.; Carputo, D.; Aversano, R. Ko te whakaraeraetanga teitei i roto i te riki e whakaatu ana i te hanganga o te kanorau ira me nga SNP whakamohiotanga e whai hua ana mo te whakatipu rapoi. Mol. momo. 2019, 39, 5. [CrossRef]
- 30. Mercati, F.; Longo, C.; Poma, D.; Araniti, F.; Lupini, A.; Mammano, MM; Fiore, MC; Abenavoli, MR; Sunseri, F Rerekētanga ira o te tōmato noho roa o Itari (Solanum lycopersicum L.) kohikohinga ma te whakamahi i te SSR me nga huanga huatau. Genet. Rauemi. Croop Evol. 2014, 62, 721-732. [CrossRef]
- 31. Gonzalez-Perez, S.; Mallor, C.; Garces-Claver, A.; Merino, F.; Taboada, A.; Rivera, A.; Pomar, F.; Perovic, D.; Silvar, C. Te torotoro i te kanorau ira me nga ahuatanga o te kounga i roto i te kohinga riki (Allium cepa L.) whenua mai i te raki-hauauru o Spain. Iranga 2015, 47, 885-900. [CrossRef]
- 32. Lotti, C.; Iovieno, P.; Centomani, I.; Marcotrigiano, AR; Fanelli, V.; Mimiola, G.; Summo, C.; Pawana, S.; Ricciardi, L. Iranga, koiora-agronomic, me te tohu kai o te kale (brassica oleracea L. var. acephala) kanorau ki Apulia, ki te tonga o Itari. Diversity 2018,10, 25. [CrossRef]
- 33. Bardaro, N.; Marcotrigiano, AR; Bracuto, V.; Mazzeo, R.; Ricciardi, F.; Lotti, C.; Pawana, S.; Ricciardi, L. Te tātari ira o te ātete ki Orobanche crenata (Forsk.) in a pea (Pisum sativum L.) raina iti-strigolactone. J. Plant Pathol. 2016, 98, 671-675.
- 34. Wako, T.; Tsukazaki, H.; Yaguchi, S.; Yamashita, K.; Ito, S.; Shigyo, M. Te Mahere o te waahi ine ine mo te wa tutakina i te paihere riki (Allium fistulosum L.). Euphytica 2016, 209, 537-546. [CrossRef]
- 35. Dhaka, N.; Mukhopadhyay, A.; Paritosh, K.; Gupta, V.; Pental, D.; Pradhan, AK Te tautuhi i nga SSR tipua me te hanga i tetahi mapi hono-a-SSR i roto Brassica juncea. Euphytica 2017, 213, 15. [CrossRef]
- 36. Anandhan, S.; Mote, SR; Gopal, J. Te arotakenga o te tuakiri momo riki ma te whakamahi i nga tohu SSR. Kakano Sci. Hangarau. 2014, 42, 279-285. [CrossRef]
- 37. Mitrova, K.; Svoboda, P.; Ovesna, J. Ko te whiriwhiringa me te whakamana o te huinga tohu mo te rereketanga o nga tipu riki mai i te Czech Republic. Czech J. Genet. Nga momo tipu. 2015, 51, 62-67. [CrossRef]
- 38. Di Rienzo, V.; Miazzi, MM; Fanelli, V.; Sabetta, W.; Montemurro, C. Te tiaki me te tohu o te Apulian olive germplasm biodiversity. Acta Hortic. 2018,1199,1-6. [CrossRef]
- 39. Mallor, C.; Arnedo-Andres, A.; Garces-Claver, A. Te aromatawai i te rereketanga ira o te reo Paniora Allium cepa whenua mo te whakatipu riki ma te whakamahi tohu microsatellite. Sci. Hortic. 2014,170, 24-31. [CrossRef]
- 40. Rivera, A.; Mallor, C.; Garces-Claver, A.; Garcia-Ulloa, A.; Pomar, F.; Silvar, C. Te aromatawai i te rereketanga ira i roto i te riki (Allium cepa L.) whenua mai i te hauauru o Spain me te whakataurite ki te rereketanga o te Pakeha. NZJ Crop Hortic. 2016, 44, 103-120. [CrossRef]
- 41. De Giovanni, C.; Pawana, S.; Taranto, F.; Di Rienzo, V.; Miazzi, MM; Marcotrigiano, AR; Mangini, G.; Montemurro, C.; Ricciardi, L.; Lotti, C. Rerekētanga ira o te kohinga germplasm ao o te pipi (Cicer arietinum L.) tae atu ki nga urunga o Itari ka tupono ki te horo ira. Physiol. Mol. Koiora. Nga tipu 2017, 23, 197-205. [CrossRef]
- 42. Mazzeo, R.; Morgese, A.; Sonnante, G.; Zuluaga, DL; Pawana, S.; Ricciardi, L.; Lotti, C. Kanorau ira i roto i te broccoli rabe (Rapa Brassica L. subsp. sylvestris (L.) Janch.) no Itari ki te tonga. Sci. Hortic. 2019, 253, 140-146. [CrossRef]
- 43. Jakse, M.; Matini, W.; McCallum, J.; Havey, M. Ko nga polymorphisms nucleotide kotahi, indels, me te raupapatanga ngawari mo te tautuhi i te maara riki. J. Am. Ko Soc. Hortic. Sci. 2005,130, 912-917. [CrossRef]
- 44. McCallum, J.; Thomson, S.; Pither-Joyce, M.; Kenel, F. Te tātaritanga kanorau ira me te whanaketanga tohu polymorphism kotahi-nucleotide i roto i te riki topuku whakatipu i runga i nga tohu tohu raupapa-maamaa nga tohu tukurua. J. Am. Ko Soc. Hortic. Sci. 2008,133, 810-818. [CrossRef]
- 45. Baldwin, S.; Pither-Joyce, M.; Wright, K.; Chen, L.; McCallum, J. Whakawhanaketanga o nga tohu tukurua raupapa ngawari ira mo te whakatau tata i te kanorau ira i roto, i roto i te riki riki. (Allium cepa L.) taupori. Mol. momo. 2012, 30, 1401-1411. [CrossRef]
- 46. DeWoody, JA; Honeycutt, RL; Skow, LC Microsatellite tohu i roto i te tia hiku ma. J. Hered. 1995, 86, 317-319. [CrossRef] [PubMed]
- 47. Khodadadi, M.; Hassanpanah, D. riki Iranian (Allium cepa L.) nga momo whakautu ki te paheketanga o te whanautanga. Ao Appl. Sci. J. 2010,11, 426-428.
- 48. Abdou, R.; Bakasso, Y.; Saadou, M.; Baudoin, JP; Hardy, OJ Te rereketanga o te ira o te aniana Niger (Allium cepa L.) ka aromatawaihia e nga tohu tukurua raupapa ngawari (SSR). Acta Hortic. 2016,1143, 77-90. [CrossRef]
- 49. Pawana, S.; Lotti, C.; Marcotrigiano, AR; Mazzeo, R.; Bardaro, N.; Bracuto, V.; Ricciardi, F.; Taranto, F.; D'Agostino, N.; Schiavulli, A.; et al. He kahui ira motuhake i roto i te pipi kua whakatipuhia e ai ki te kitenga o te tohu ira-whanui me te tohu ira tangata. Tipu Genome 2017, 2017,10. [CrossRef]
- 50. Pawana, S.; Marcotrigiano, AR; Ciani, E.; Mazzeo, R.; Zonno, V.; Ruggieri, V.; Lotti, C.; Ricciardi, L. Te whakapapa-a-whakapapanga o te merengi (Cucumis melo L.) te kohinga germplasm mai i te pokapū tuarua o te kanorau e whakaatu ana i nga tauira o te rereketanga o te ira me nga ahuatanga ira o nga puna ira rereke. BMC Genom. 2017, 18, 59. [CrossRef]
- 51. Di Rienzo, V.; Hiona, S.; Taranto, F.; D'Agostino, N.; Montemurro, C.; Fanelli, V.; Sabetta, W.; Boucheffa, S.; Tamendjari, A.; Pasqualone, A.; et al. Rere ira i waenga i te taupori oriwa i roto i te riu Mediterranean. Hoa J. 2018, 6. [CrossRef]
- 52. Hepara, LD; McLay, TG E rua nga kawa moroiti-tauine mo te wehe i te DNA mai i te kiko o te tipu whai polysaccharide. J. Plant Res. 2011,124, 311-314. [CrossRef]
- 53. Doyle, JJ; Doyle, JL Te wehe i te DNA tipu mai i te kiko hou. arotahi 1990,12, 13-14.
- 54. Kuhl, JC; Cheung, F.; Qiaoping, Y.; Matini, W.; Zewdie, Y.; McCallum, J.; Catanach, A.; Rutherford, P.; Totohu, KC; Jenderek, M.; et al. Ko te huinga ahurei o te 11,008 riki e whakaatu ana i nga tohu raupapa e whakaatu ana i te raupapatanga me nga rereketanga ira i waenga i nga ota monocot asparagales me nga poales. Rakau Taputapu 2004,16, 114-125. [CrossRef]
- 55. Kim, HJ; Lee, HR; Hyun, JY; Waiata, KH; Kim, KH; Kim, JE; Hur, CG; Harn, CH Whakawhanaketanga Tohu mo te whakamatautau ira ira riki ma te whakamahi SSR Finder. Korean J. Breed. Sci. 2012, 44, 421-432. [CrossRef]
- 56. Schuelke, M. He tikanga ohaoha mo te tapanga rewharewha o nga kongakonga PCR. Nat. Hangarau koiora. 2000, 18, 233-234. [CrossRef] [PubMed]
- 57. Peakall, R.; Smouse, PE GenAlEx 6.5: Te tātari ira i Excel. Pūmanawa ira tangata mo te whakaako me te rangahau: He whakahou. Bioinformatics 2012, 28, 2537-2539. [CrossRef] [PubMed]
- 58. Kalinowski, ST; Taper, ML; Marshall, TC Ko te arotake me pehea te whakaurunga a te papatono rorohiko CERVUS i te hapa ira tangata ka piki ake te angitu i roto i te mahi papa. Mol. Ekol. 2007,16, 1099-1106. [CrossRef]
- 59. Pritchard, JK; Tepene, M.; Rosenberg, NA; Donnelly, P. Association mapping in structured populations. Am. J. Hum. Genet. 2000, 67, 170-181. [CrossRef]
- 60. Evanno, G.; Regnaut, S.; Goudet, J. Te kimi i te maha o nga tautau o nga tangata takitahi e whakamahi ana i te raupaparorohiko STRUCTURE: He rangahau whaihanga. Mol. Ekol. 2005,14, 2611-2620. [CrossRef]
- 61. Earl, D.; VonHoldt, B. STRUCTURE HARVESTER: He paetukutuku me te kaupapa mo te tiro i te putanga STRUCTURE me te whakatinana i te tikanga Evanno. Tiaki. Genet. Rauemi. 2011, 4. [CrossRef]
- 62. Takezaki, N.; Nei, M.; Tamura, K. POPTREEW: Putanga Tukutuku o POPTREE mo te hanga rakau taupori mai i nga raraunga auau allele me te tarai i etahi atu rahinga. Mol. Koiora. Putanga. 2014, 31, 1622-1624. [CrossRef]
- 63. Kumar, S.; Stecher, G.; Li, M.; Knyaz, C.; Tamura, K. MEGA X. Molecular Evolutionary Genetics Analysis puta noa i nga papa rorohiko. Mol. Koiora. Putanga. 2018, 35, 1547-1549. [CrossRef]